Laboratorium merupakan tempat untuk mengaplikasikan teori keilmuan, pengujian teoritis, pembuktian uji coba, penelitian dan sebagainya dengan menggunakan alat bantu yang menjadi kelengkapan dari fasilitas dengan kuantitas dan kualitas yang memadai. Fakultas Ilmu Kesehatan Universitas Nahdlatul Ulama Sunan Giri mempunyai lima laboratorium diantaranya yaitu laboratorium teknologi farmasi, laboratorium compounding dan dispensing, laboratorium analisis kimia, laboratorium farmakologi dan laboratorium biologi farmasi.